首都醫科大學附屬北京兒童醫院于上個世紀八十年代開始進行小兒腹膜透析治療，1994年4月成立了兒童血液透析室，在國內率先開展了兒童腹膜透析和血液透析治療，并于2002年掛牌成為北京市兒童血液凈化中心，是國內成立最早、規模最大的兒童專業血液凈化中心。科室創始人沈穎教授是國內外知名專家，博士生導師，兒童慢性腎臟病與血液凈化北京市重點實驗室主任。1995-1997年赴意大利都靈女皇兒童醫院腎科深造。1994在國內率先開展兒童血液透析治療，2002年建立國內規模最大的小兒血液凈化中心，舉辦十余期全國小兒腎臟及血液凈化學習班。2010年組建了中國醫師協會兒科分會血液凈化專委會，主編了我國第一部兒童血液凈化專業書籍，將小兒血液凈化技術推廣至全國。

經過近30年的穩步發展，幾代人的共同努力，血液凈化專業醫療及科研水平達國內先進水平并與國際接軌。 在此基礎上，2020年在醫院重點支持下成為獨立科室—北京兒童醫院血液凈化中心。自此，我院血液凈化中心進入全新的發展時期。

北京兒童醫院血液凈化中心技術力量雄厚，擁有醫護人員10余名，所有的醫護人員均具有豐富的血液凈化知識和臨床經驗，開設床位10余張，擁有世界上最先進的血液透析機11臺，CRRT機4臺，全自動腹膜透析機4臺，目前已治療1000余例兒童患者，累計2.5萬余人次，承擔了腎臟、急救、血液腫瘤及神經內科等專業不同病因患兒的血液凈化治療工作，開展兒童血液透析、腹膜透析、血液灌流、血漿置換、免疫吸附、持續床旁血液濾過等血液凈化技術，危重腎臟疾病的血液凈化治療水平居于全國領先地位。