國家自然科學基金青年項目，基于原位培養和質譜數據可視化分析深度挖掘阿里高原區沙漠中的藥用放線菌資源，項目編號32200001，30萬元，執行年限2023.1-2025.12，項目主持人李飛娜。

國家自然科學基金面上項目，GBP5通過影響蛋白質乳酸化修飾調控巨噬細胞抗結核免疫應答的機制研究，項目編號82172280，68.2萬元，執行年限2022.1-2025.12，項目主持人申阿東。

國家自然科學基金面上項目，脂蛋白Rv1411c與宿主CypA相互作用介導結核分枝桿菌在巨噬細胞內存活的機制研究，項目編號82170007，執行年限2022.1-2025.12，項目主持人孫琳。

國家自然科學基金青年項目，結核感染引發RNA-m6A修飾調控線粒體自噬介導炎癥反應的機制研究，項目編號82100010，24萬元，執行年限2022.1-2025.12，項目主持人徐放。

國家自然科學基金委員會與俄羅斯基礎研究基金會合作研究項目，成人與兒童結核病發展的綜合研究：細菌菌株和周圍微生物組的影響，項目編號81961138012，100萬元，執行年限2020.1-2022.12，中方負責人、申阿東。

國家自然科學基金面上項目，GBP5和IRF9相互作用介導結核感染后IFN-β抑制巨噬細胞炎癥小體活化的機制研究，項目編號81871617，57萬，執行年限2019.01-2022.12，項目主持人申阿東。

國家自然科學基金青年項目，SEMA4A蛋白通過調節Rho GTPase活性而促進巨噬細胞遷移和結核性肉芽腫形成的機制研究，項目編號81801976，21萬，執行年限2019.1-2021.12，項目主持人李潔瓊。

國家自然科學基金青年項目，GBP5在抗結核感染中對巨噬細胞炎癥小體調控的機制研究，項目編號81701971，20萬元，執行年限2018.1-2020.12，項目負責人綦輝。

國家科技重大專項，艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治專項，“一帶一路”結核病診療示范基地，東非、中亞和東南亞等區域重要傳染病防控關鍵保障技術研究課題中“結核病診療技術及產品推廣”任務中的子任務“種族兒童結核病生物樣本庫的建立與診療技術驗證和示范推廣”，項目編號2018ZX10101004-002-005，54.3萬元，執行年限2018.1-2021.6，項目負責人綦輝。

國家科技重大專項，艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治專項，結核病多重組合診斷技術的多中心評估課題子課題三“兒童等其他結核病診斷的組合技術多中心應用評估”， 項目編號2018ZX10103001，195.24萬，執行年限2018.1-2020.12，項目負責人孫琳。

國家自然科學基金應急管理項目，結核分枝桿菌rpoA/C突變在利福平耐藥及菌株傳播中的作用，項目編號81541062，12萬，執行年限2016.1-2016.12，項目主持人焦偉偉。

國家自然科學基金青年項目，宿主IFITM3基因在巨噬細胞抗結核感染中的免疫調控功能研究，項目編號 81301403，23萬，執行年限2014.01-2016.12，項目主持人申晨。