北京兒童醫院眼科為擁有專業門診、病房、醫技檢查、驗光配鏡中心、弱視訓練、視感知覺治療工作室為一體的綜合性兒童眼病診療中心，同時為北京市殘聯指定殘疾評估、康復中心，并托管北京兒童醫院保定醫院、北京市順義區婦幼保健院、北京兒童醫院鄭州醫院、北京兒童醫院新疆醫院、北京兒童醫院黑龍江醫院。

有醫護技人員共80人，其中醫生33名，其中教授、博士生導師1名，副教授、碩士生導師3名，有博士學位31人。視光技師及弱視訓練師13名，護士34名。

目前眼科設有斜弱視、神經眼科、角膜病、眼整形、淚道病、青光眼、白內障、眼底病、眼腫瘤等專業。北京兒童醫院及托管醫院眼科共有病床49張，年均手術量5700余例，其中內眼手術約1300例，每年接診來自全國各地的眼病患兒約27.8萬人次。在小兒斜弱視、近視、淚道疾病、眼整形、兒童角膜移植、眼腫瘤、眼底病篩查及治療、視神經疾病、遺傳性眼病、青光眼白內障診治、微創玻璃體切割手術及角膜塑形鏡、兒童RGP鏡片及特種眼鏡驗配等方面積累了豐富的經驗。

開展的特色診療項目包括特發性眼球震顫等復雜斜視的手術治療及發病機制研究，兒童及嬰幼兒角膜移植手術，兒童眼球震顫及白內障術后個性化視覺功能重建，早產兒視網膜病變的綜合診治，Ritleng淚道插管手術、微創淚道重建術、鼻內窺鏡鼻腔淚囊吻合術等治療復雜兒童淚道疾病、利用GORE-TEX新型材料進行額肌懸吊術治療兒童上瞼下垂，先天性小瞼裂綜合征微創手術，視網膜母細胞瘤的個性化綜合治療， 360°微導管引導下小梁切開術治療先天性青光眼等。

目前可以完成嬰幼兒、兒童、青少年視覺電生理、視網膜電圖、視野、OCT、眼部彩超、UBM、IOL-master、角膜地形圖、角膜內皮鏡、眼震電圖、嬰幼兒視力檢測及屈光篩查、新生兒Retcam廣角數字眼底檢查、3D人機交互視覺信息檢測等特殊眼科檢查，彌補了很多大型三甲醫院無法做兒童眼科檢查的遺憾，檢查儀器設備及技術水平居國內領先水平。

在教學方面，承擔首都醫科大學7年制兒科系的教學任務，承擔每年來自全國各地基層小兒眼科進修醫師的培訓工作。舉辦多次國際、國內學術會議及國家級、市級小兒眼科繼續教育學習班。

在科研方面，獲得包括2項國家自然科學基金在內的20余項國家級、省部級課題資助，在國內外專業期刊上發表論文上百篇，其中SCI收錄論文數十篇，獲得國家發明專利多項，在中華醫學會眼科學分會、中國醫師協會眼科醫師分會、中國婦幼保健協會兒童眼保健專業委員會、美國視覺與眼科學會等國內外多個重要學術團體中有學術任職，多次參加國內外學術交流，多批次外派學術帶頭人、中青年骨干、年輕醫生在國內外進修學習。

同時積極參加各種公益活動，連續舉行全國性大型公益項目“愛目行動”，每年進行愛眼日系列科普宣傳活動，應國家及北京市衛健委邀請每年進行多場近視防控科普講座，多次赴西藏、青海、甘肅、湖北、四川等地及京津冀地區進行扶貧、眼病篩查及義診活動。